抓捕神兽需要掌握特定的触发条件和战术策略。部分神兽如凤王和洛奇亚需要先获得特殊道具才能触发遭遇。例如凤王需要通关后从圆朱市商店右侧的老人处取得彩虹羽毛，随后前往塔顶进行战斗；而洛奇亚则需在击败火箭队后获得银色羽毛，前往漩涡列岛深处的洞窟。这些关键道具往往隐藏在主线剧情或支线任务中，需要玩家仔细探索地图并与NPC互动才能获取。
针对会逃跑的神兽如炎帝、雷皇和水君，需利用游戏机制提高抓捕效率。炎帝和雷皇在烧焦塔解封后会在城都地区随机出现，见面即逃跑，建议携带会黑色眼神或追击技能的宝可梦封锁其退路。水君则按固定路线移动，需在湛蓝市海滩、42号道路等地点多次拦截，最终在25号道路正辉家附近触发战斗。手表的地图追踪功能可实时显示神兽位置，合理利用能大幅减少盲目搜索的时间。
神兽普遍等级较高且拥有强力技能，建议队伍中配置状态异常手，如使用催眠术或麻痹粉控制目标，同时携带刀背打技能的宝可梦将神兽血量压至1点。道具方面，高级球、计时球或黑暗球能根据战斗场景提升捕获率。若条件允许，可提前通过剧情获取大师球，但需谨慎分配使用机会。
例如裂空座需将古拉顿和海皇牙传至同一卡带，再找大木博士换取绿色宝玉；超梦则需通关后前往华蓝之洞窟。阿鲁夫遗迹的未知图腾密室则要求解谜并集齐26种形态，触发研究员剧情后才能遭遇特殊形态图腾。这类神兽的抓捕更注重流程推进而非即时战术，建议提前规划游戏进度。
神兽抓捕往往需要反复尝试，尤其是低血量+异常状态的组合未必一次生效。建议存档后多次调整策略，同时确保背包内有足量回复道具和精灵球。对于需要联机或特殊活动获取的神兽，可参考合法途径的补充说明，但需注意部分限定神兽无法通过常规游戏流程捕获。
