战斗机是舰队作战的重要组成部分，而能否搭载战斗机取决于舰船类型和机库配置。游戏中的航空母舰和部分支援型舰船具备搭载战斗机的能力，但需要玩家通过蓝图研究解锁对应模块，并合理分配技术点以优化战斗机的作战效率。
战斗机的搭载并非简单地将飞机放入舰船，而是需要综合考虑舰船的机库容量、战机类型以及战术需求。永恒苍穹级航空母舰拥有弧形机库设计，可同时容纳舰载机和无人机编队，实现协同作战。这种设计让少量舰载机发挥更大效能，但需注意机库扩展模块的选择，如大型战机机库或维修无人机机库，会直接影响战斗机的出勤率和生存能力。
战斗机的性能提升依赖于技术点分配和装备强化。玩家需优先加点战斗机的武器系统，如冷却缩减、伤害提升和命中率优化，同时兼顾装甲系统的生存能力。孢子A404轻型战斗机主打对空作战，其加点应聚焦空战策略和打击间隔缩短；而刺鳐鱼雷轰炸机则需强化鱼雷伤害和暴击率，以针对大型舰船。
实战中，战斗机的部署需要结合舰队阵型和战场环境。航空母舰通常作为后排单位，需搭配前排抗伤舰船保护。战斗机的目标选择机制会优先攻击敌方中型舰或防空薄弱目标，因此玩家需通过战术调整避免战斗机被敌方防空火力集中压制。护航艇的加入能为战斗机提供额外防空支援，进一步延长其战场存活时间。
无尽的拉格朗日的战斗机系统具备深度策略性，从搭载条件到实战应用均需玩家细致规划。合理利用舰船机库和战机特性，能在太空战中占据显著优势。
